菊池神社の主祭神は第１２代菊池武時公、第１３代武重公、第１５代武光公で、第１６代武政以下２６柱が配祀されています。菊池神社は慶応4年（1868年）、皇室に忠義を尽くしてきた菊池一族を称えて、明治天皇が熊本藩に菊池氏を顕賞し祭祀を行うよう命じられました。これにより、明治3年（1870年）菊池城本丸址に社殿を造営、同年４月２８日に鎮座せられ、明治11年に別格官幣社に列せられました。菊池神社の周囲一体は桜・つつじの名所で、桜の花の頃は多くの行楽客で賑わいます。